يتضمن برنامج الماجستير في الرياضيات مسارين هما :

  • مسار الرساله
  • مسار الامتحان الشامل

على الطالب الذي يسلك مسار الرساله أن يجتاز (33) ساعه معتمده بنجاح  منها (15) ساعه من المواد الاجباريه و(9) ساعات من المواد الاختياريه, أما الطالب الذي يختار مسار الرساله عليه أن يجتاز(33) ساعه معتمده بنجاح منها (24) ساعه من المواد الاجباريه و(9) ساعات من المواد الاختياريه بالاضافه الى اجتياز الامتحان الشامل وفق تعليمات درجة الماجستير في الجامعه.